MPIRUN命令手册

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并行框架用openmpi或者mpich，这里以openmpi为例

【环境安装】

1、下载openmpi-xx-xx包，比如openmpi-1.10.3.tar.gz
2、解压 tar -zxvf openmpi-1.10.3.tar.gz
3、./configure --prefix=/usr/software/openmpi
4、make && make install
5、在.bashrc里加入环境变量
    MPI_HOME=/usr/software/openmpi
    export PATH=$MPI_HOME/bin:$PATH
    export LD_LIBRARY_PATH=$MPI_HOME/lib:$LD_LIBRARY_PATH
6、source ~/.bashrc
安装完成！

【执行mpirun】

单节点多线程模式（以天河上节点为例）
mpirun --allow-run-as-root -np 4 exec.sh

说明：root用户需要加–allow-run-as-root；此处表示单节点上运行4个进程。

多节点多线程模式（比如在N1节点上运行该程序）

mpirun --allow-run-as-root -np 4 --mca btl_tcp_if_include enp8s0f1 --mca orte_base_help_aggregate 0 --map-by node --hostfile host exec.sh

运行流程图

说明：

  • 天河节点上需要加 –mca btl_tcp_if_include enp8s0f1 –mca orte_base_help_aggregate 0这些参数（根据报出的问题知晓的）
  • btl_tcp_if_include表示节点间通信的网卡。
  • 注意：多节点上运行时需要进行linux主机上ssh免密设置，详见多节点免密配置
  • –map-by node 表示按host中设置的主机轮询的分配这 -np个线程。